Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITRM1Q5JRX3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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