Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C3orf38Q5JPI3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf38Q5JPI3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf38Q5JPI3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms