Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALFQ53S48 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms