Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LACTB2Q53H82 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LACTB2Q53H82 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms