Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM259Q4ZIN3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms