Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A4Q4VNC1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms