Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTXN3Q4LDR2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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