Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS9Q3SYG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms