Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A52Q3SY17 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC25A52Q3SY17 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms