Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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