Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LETM2Q2VYF4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LETM2Q2VYF4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LETM2Q2VYF4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LETM2Q2VYF4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
LETM2Q2VYF4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LETM2Q2VYF4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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