Protein–RNA interactions for Protein: Q2PPJ7

RALGAPA2, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA2Q2PPJ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RALGAPA2Q2PPJ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RALGAPA2Q2PPJ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALGAPA2Q2PPJ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALGAPA2Q2PPJ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms