Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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