Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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