Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCAQ16586 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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