Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDB1Q16531 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
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DDB1Q16531 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
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DDB1Q16531 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
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DDB1Q16531 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
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