Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F4Q16254 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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