Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC9A3R2Q15599 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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