Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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