Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSU1Q15404 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSU1Q15404 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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