Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms