Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFIXQ14938 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
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