Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNAB1Q14722 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNAB1Q14722 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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