Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms