Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
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