Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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