Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBFBQ13951 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms