Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMB3Q13751 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMB3Q13751 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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