Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P11Q13670 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P11Q13670 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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