Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
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