Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL3Q13618 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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