Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2BQ13554 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms