Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPM6BQ13491 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPM6BQ13491 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms