Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSAMPQ13449 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSAMPQ13449 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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