Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H3Q13133 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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