Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC16Q13042 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC16Q13042 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms