Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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