Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDR1Q08345 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms