Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP1-1Q07627 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms