Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL18Q07020 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms