Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 IRC22YEL001C 678 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YGR111WYGR111W 1203 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 PCT1YGR202C 1275 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 GAT4YIR013C 366 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 SSP120YLR250W 705 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 MID2YLR332W 1131 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YML119WYML119W 1074 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 SPS19YNL202W 879 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 RRG9YNL213C 645 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 SME1YOR159C 285 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 TGS1YPL157W 948 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 ATG1YGL180W 2694 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 SDA1YGR245C 2304 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 TRM1YDR120C 1713 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 RPT4YOR259C 1314 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 PIF1YML061C 2580 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 RAT1YOR048C 3021 nt5.42□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 NRD1YNL251C 1728 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YCL065WYCL065W 369 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 CBS1YDL069C 690 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 snR83snR83 306 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 SEH1YGL100W 1050 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 SDT1YGL224C 843 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 NQM1YGR043C 1002 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 PNT1YOR266W 1272 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YBR063CYBR063C 1215 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 DIM1YPL266W 957 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 TEF1YPR080W 1377 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 TEF2YBR118W 1377 nt5.41□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 GAS5YOL030W 1455 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 QRI7YDL104C 1224 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 CWC23YGL128C 852 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YGL199CYGL199C 471 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YGL214WYGL214W 486 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 RSM27YGR215W 333 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 TVP38YKR088C 1014 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 BOS1YLR078C 735 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YLR456WYLR456W 615 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 SPG4YMR107W 348 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 YNL050CYNL050C 813 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 MRPL22YNL177C 930 nt5.4□□□□□ -1.54
CDA1Q06702 ART10YLR392C 1557 nt5.4□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt5.4□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 TCM62YBR044C 1719 nt5.4□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SSY5YJL156C 2100 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 IME4YGL192W 1803 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 TRK2YKR050W 2670 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 snR7-LsnR7-L 214 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 CDC43YGL155W 1131 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YIP5YGL161C 933 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 DOG2YHR043C 741 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 DOG1YHR044C 741 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 ARP1YHR129C 1155 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SOL3YHR163W 750 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SNL1YIL016W 480 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 AAD10YJR155W 867 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 GSP1YLR293C 660 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YBR053CYBR053C 1077 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 snR37snR37 386 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YJR061WYJR061W 2808 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 UTP9YHR196W 1728 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 ALT1YLR089C 1779 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SER3YER081W 1410 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 IBA57YJR122W 1494 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SHM1YBR263W 1473 nt5.39□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 NSI1YDR026C 1713 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 GLO2YDR272W 825 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PFS1YHR185C 714 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 AIM18YHR198C 966 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PRS1YKL181W 1284 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 RPS0BYLR048W 759 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SEC17YBL050W 879 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YOR114WYOR114W 885 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 COX11YPL132W 903 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 LDH1YBR204C 1128 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 BUD8YLR353W 1812 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SPS2YDR522C 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SSZ1YHR064C 1617 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YIL067CYIL067C 2037 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 MDH3YDL078C 1032 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YFL064CYFL064C 525 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PRP38YGR075C 729 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 RPL24BYGR148C 468 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 COS8YHL048W 1146 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YLR339CYLR339C 552 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 RIF2YLR453C 1188 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PGA3YML125C 939 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PRE7YBL041W 726 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 INP1YMR204C 1263 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 COG5YNL051W 1212 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 DUG3YNL191W 1074 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 MED7YOL135C 669 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 IRC13YOR235W 315 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PLP2YOR281C 861 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YPR202WYPR202W 717 nt5.37□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 FHL1YPR104C 2811 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 RTA1YGR213C 954 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 AIM19YIL087C 474 nt5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29 ms