Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PSME1Q06323 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms