Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms