Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms