Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRKCZQ05513 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCZQ05513 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms