Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms