Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms