Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms