Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCB3Q01970 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms