Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms